Será propósito esencial de la Academia trabajar en estrecha cooperación con las entidades públicas y privadas, nacionales o extranjeras que persigan análogos fines, en la difusión constante de libros y estudios referentes a la medicina nacional, en procura de su creciente conocimiento y su eficaz enseñanza, y en despertar y avivar el interés por la historia de la medicina nacional, honrando y enalteciendo la vida y obra de sus grandes maestros.
La Academia mantendrá intercambios científicos con organizaciones similares o afines nacionales y extranjeras en los campos de su competencia, y podrá organizar o colaborar en la organización de conferencias, reuniones, simposios, coloquios y foros relacionados con la profesión médica, utilizando los medios que a su alcance le ofrezcan los sistemas de divulgación y la tecnología moderna

La Academia Nacional de Medicina colaborará con las academias de medicina actualmente existentes en el país. Las que en lo sucesivo se establezcan en el territorio nacional podrán solicitar que se las considere filiales de la Academia Nacional de Medicina, sin que esta afiliación, de ser aceptada por la Academia, implique disminución alguna de la autonomía de aquellas, ni de la solidaridad de esta con sus juicios y determinaciones.
La Academia tendrá su sede en la ciudad de Bogotá, D.C. y podrá crear Capítulos en los departamentos cuyo desarrollo universitario o científico así lo justifique.